Çin’in Wuhan kentindeki bir pazardan elde edilen genetik veriler üzerine yapılan yeni bir araştırma, verilerin salgının yasa dışı olarak ticareti yapılan hayvanlarla başladığı iddiasını desteklemediğini belirterek, diğer bilim adamlarının yapbozun önemli parçaları olarak gördüğü örnekler üzerinde yeni tartışmalara yol açtı. insanlara ulaştı.
2020’nin başlarında piyasadaki yüzeylerden alınan sürüntülerdeki hayvansal ve viral materyalin nispi miktarlarını inceleyen yeni çalışma, virüsün belirli örneklerinin enfekte canlı hayvanlardan mı yoksa sadece kazara kontaminasyondan mı geldiğine dair sonuçlara varmanın zor olduğunu söyledi.
Ancak birkaç dış uzman, Fred Hutchinson Kanser Merkezi’nde bir virolog olan çalışma yazarı Jesse Bloom tarafından bu hafta çevrimiçi olarak yayınlanan analizin, bir dizi bilinmeyen değişkenden etkilendiğini ve verilerin nasıl filtreleneceğine ilişkin kararların olabileceğini söyledi.
Bu nedenlerden dolayı, sonuçların önceki çalışmalara ilişkin izlenimlerini etkilemek için fazla bir şey yapmadığını söylediler. Hayvan ve viral genetik materyal içeren pazardan alınan numunelerin, oradaki bir hayvanın – belki bir rakun köpeğinin – virüsü insanlara bulaştırmış olma olasılığıyla tutarlı olduğunu, ancak bunu kanıtlamadığını söylediler.
Pennsylvania Üniversitesi’nde Wuhan’dan alınanlar gibi örnekleri analiz etmede uzman bir mikrobiyolog olan Frederic Bushman, “Bence enfekte bir rakun köpeği kapma şansları oldukça makul, ancak bu, kökenin bu olduğunu kanıtlamıyor” dedi. piyasa araştırmalarının hiçbirinde yer almamıştır. “Bloom gazetesinin düşüncelerimi o kadar da değiştirdiğini düşünmüyorum.”
Çinli araştırmacılar geçen yıl piyasa verileri hakkında yazdılar ve bu yıl genetik dizileri uluslararası bilim adamlarından oluşan bir ekibin çalışması için kullanıma sundular. O ekip geçen ay bir raporda, verilere dayanarak virüsü insanlara bulaştıran bir hayvanı tespit edemediklerini yazmıştı.
Bununla birlikte, verilerin, yirmi yıl önce SARS salgınına karışan küçük bir Asya memelisi olan rakun köpekleri ve maskeli misk kedileri gibi virüse duyarlı olduğu düşünülen hayvanların pazara satıldığını doğruladığını söylediler. Bu ilk Covid-19 hastalarının çoğu aynı zamanda pazarda çalıştı veya alışveriş yaptı.
Pazar, Wuhan’da virüsü makul bir şekilde yayabilecek türden canlı hayvanların satıldığı dört yerden biri olduğu için, bilim adamları, bu kadar çok erken hastanın pazara tamamen tesadüfen bağlanmasının olası olmadığını söylediler. Genetik verilerin, virüsün iki erken soyunun piyasada olduğu gerçeği de dahil olmak üzere başka kanıtlara dayandığını söylediler.
Bu haftaki çalışma, gen dizilerini analiz etmek için farklı bir yaklaşım benimsedi.
doktor Bloom, virüsten gelen genetik materyal miktarının, numunelerdeki duyarlı hayvan türlerinden elde edilen genetik materyal miktarı ile ilişkili olup olmadığını araştırdı. Bir röportajda, piyasadaki bir türün virüsün yayılmasından ağırlıklı olarak sorumlu olması durumunda, virüsteki genetik materyal miktarı ile o türün miktarı arasında açık bir bağlantı görmeyi bekleyeceğini söyledi.
Bununla birlikte, çalışma, bu türden net bir ilişki bulamadı.Bunun yerine, en güçlü korelasyonlar, piyasada satılan ve enfekte olamayacak farklı balıklar arasındaydı, bu da enfekte bireylerin muhtemelen balığın bulunduğu yerde viral materyal biriktirdiğini gösteriyor.
doktor Bloom, bulgunun SARS-CoV-2 olarak da bilinen virüsün 2020’nin başlarında örneklerin alındığı tarihte piyasada yaygın olduğunu gösterdiğini söyledi.
“Aynı şekilde, ne çipura levrek ve yayın balığı örnekleriyle karıştırılmış bir grup SARS-CoV-2 olduğu gerçeğini ne de SARS- ile bir rakun köpeği örneği olduğu gerçeğini çok fazla okumamalıyız. CoV-2 testi” dedi Dr. Çiçek açmak.
Ancak dışarıdan uzmanlar, numunelerin çeşitli özelliklerinin hayvan ve viral materyal arasında bağlantı kurma çabalarını engelleyebileceğini söyledi. Uluslararası bilim adamları raporlarında benzer bir analiz yapmayı düşündüklerini ancak yanıltıcı sonuçlar verme riskinin olduğunu söylediler. doktor Bloom, “hesaplamanın anlamlı olup olmadığı açık bir soru” olduğunu kabul etti.
Weill Cornell Medicine’de çevresel numune alma uzmanı olan Christopher Mason, virüsün genetik materyalinin hızla bozulduğunu söyledi. En önemlisi, viral materyal hayvanlardan alınan materyalden farklı bir oranda parçalanabilir ve bu da pazar kapandıktan sonraki haftalar boyunca toplanan örneklerde bunların karşılaştırılmasını zorlaştırabilir.
Belçika’daki KU Leuven’de evrimsel bir biyolog olan Tom Wenseleers, balığın virüsle en yakından ilişkili olmasının nedeni, balığın muhtemelen donmuş veya buzdolabında olması olabilir, bu da bu örneklerdeki viral materyalin çürümesini yavaşlattı.
Dr. Wenseleers. Bu, bilim adamlarını daha önce olduğu gibi aynı pozisyonda bırakıyor, dedi, piyasa verileri herhangi bir belirli köken senaryosu için kesin bir kanıt sunmuyor.
Yeni çalışma ayrıca, uluslararası ekibin rakun köpeklerinin genetik imzalarının yanı sıra virüsün izlerini bulduğu, ancak saptanabilir insan genetik materyali bulunmadığı, pazardaki bir arabadan alınan bir sürüntüyü de yakından inceledi.
doktor Bloom, sürüntünün yalnızca çok az miktarda viral malzeme içerdiğini ve Çinli araştırmacıların çubuğu neden Kovid pozitif olarak sınıflandırdığının net olmadığını yazdı. Çalışması, sürüntünün virüs izleri içeren önemli miktarda rakun köpeği genetik materyali içeren tek örnek olduğunu söyledi.
Ancak bazı bilim adamları, Dr. Bloom’un analizi, bir numunedeki hayvan genetik materyali miktarı için çıtayı çok yükseğe ayarlayarak diğer Covid-pozitif sürüntülerin reddedilme riskini aldı.
doktor Pennsylvania Üniversitesi’nden Bushman, analizde kullanılan eşiğin “agresif” olduğunu ve bir dizi farklı eşikten elde edilen sonuçları karşılaştırmanın en iyisi olduğunu söyledi.
Uluslararası bilim insanları ekibi, daha hassas bir eşik kullanarak, rakun köpeklerinden genetik materyal içeren birkaç Kovid-pozitif numunenin yanı sıra virüse duyarlı olduğu düşünülen farklı hayvanlardan genetik imzalara sahip diğerleri belirledi.
Daha önce Johns Hopkins Üniversitesi’nde çalışan ve uluslararası ekibin analizine öncülük eden hesaplamalı bir biyolog olan Alexander Crits-Christoph, ekibin ayrıca Çinli araştırmacıların arabadan alınan sürüntü testinde virüsü tanımladığı için pozitif olup olmadığını dikkatlice kontrol ettiğini söyledi.
Aynı ahırdan alınan bir dizi başka sürüntünün virüs için açıkça pozitif olduğunu buldu. Pazarda başka bir yerden alınan örneklerden elde edilen sonuçların, gerçekten negatif olan eküvyonların çoğunun, arabadan alınan eküvyonların aksine hiçbir virüs izi içermediğini gösterdiğini söyledi.
“Bu, samanlıkta küçük bir iğne olan bir virüsün çevresel örneklemesidir” dedi Dr. Crits-Christoph.
2020’nin başlarında piyasadaki yüzeylerden alınan sürüntülerdeki hayvansal ve viral materyalin nispi miktarlarını inceleyen yeni çalışma, virüsün belirli örneklerinin enfekte canlı hayvanlardan mı yoksa sadece kazara kontaminasyondan mı geldiğine dair sonuçlara varmanın zor olduğunu söyledi.
Ancak birkaç dış uzman, Fred Hutchinson Kanser Merkezi’nde bir virolog olan çalışma yazarı Jesse Bloom tarafından bu hafta çevrimiçi olarak yayınlanan analizin, bir dizi bilinmeyen değişkenden etkilendiğini ve verilerin nasıl filtreleneceğine ilişkin kararların olabileceğini söyledi.
Bu nedenlerden dolayı, sonuçların önceki çalışmalara ilişkin izlenimlerini etkilemek için fazla bir şey yapmadığını söylediler. Hayvan ve viral genetik materyal içeren pazardan alınan numunelerin, oradaki bir hayvanın – belki bir rakun köpeğinin – virüsü insanlara bulaştırmış olma olasılığıyla tutarlı olduğunu, ancak bunu kanıtlamadığını söylediler.
Pennsylvania Üniversitesi’nde Wuhan’dan alınanlar gibi örnekleri analiz etmede uzman bir mikrobiyolog olan Frederic Bushman, “Bence enfekte bir rakun köpeği kapma şansları oldukça makul, ancak bu, kökenin bu olduğunu kanıtlamıyor” dedi. piyasa araştırmalarının hiçbirinde yer almamıştır. “Bloom gazetesinin düşüncelerimi o kadar da değiştirdiğini düşünmüyorum.”
Çinli araştırmacılar geçen yıl piyasa verileri hakkında yazdılar ve bu yıl genetik dizileri uluslararası bilim adamlarından oluşan bir ekibin çalışması için kullanıma sundular. O ekip geçen ay bir raporda, verilere dayanarak virüsü insanlara bulaştıran bir hayvanı tespit edemediklerini yazmıştı.
Bununla birlikte, verilerin, yirmi yıl önce SARS salgınına karışan küçük bir Asya memelisi olan rakun köpekleri ve maskeli misk kedileri gibi virüse duyarlı olduğu düşünülen hayvanların pazara satıldığını doğruladığını söylediler. Bu ilk Covid-19 hastalarının çoğu aynı zamanda pazarda çalıştı veya alışveriş yaptı.
Pazar, Wuhan’da virüsü makul bir şekilde yayabilecek türden canlı hayvanların satıldığı dört yerden biri olduğu için, bilim adamları, bu kadar çok erken hastanın pazara tamamen tesadüfen bağlanmasının olası olmadığını söylediler. Genetik verilerin, virüsün iki erken soyunun piyasada olduğu gerçeği de dahil olmak üzere başka kanıtlara dayandığını söylediler.
Bu haftaki çalışma, gen dizilerini analiz etmek için farklı bir yaklaşım benimsedi.
doktor Bloom, virüsten gelen genetik materyal miktarının, numunelerdeki duyarlı hayvan türlerinden elde edilen genetik materyal miktarı ile ilişkili olup olmadığını araştırdı. Bir röportajda, piyasadaki bir türün virüsün yayılmasından ağırlıklı olarak sorumlu olması durumunda, virüsteki genetik materyal miktarı ile o türün miktarı arasında açık bir bağlantı görmeyi bekleyeceğini söyledi.
Bununla birlikte, çalışma, bu türden net bir ilişki bulamadı.Bunun yerine, en güçlü korelasyonlar, piyasada satılan ve enfekte olamayacak farklı balıklar arasındaydı, bu da enfekte bireylerin muhtemelen balığın bulunduğu yerde viral materyal biriktirdiğini gösteriyor.
doktor Bloom, bulgunun SARS-CoV-2 olarak da bilinen virüsün 2020’nin başlarında örneklerin alındığı tarihte piyasada yaygın olduğunu gösterdiğini söyledi.
“Aynı şekilde, ne çipura levrek ve yayın balığı örnekleriyle karıştırılmış bir grup SARS-CoV-2 olduğu gerçeğini ne de SARS- ile bir rakun köpeği örneği olduğu gerçeğini çok fazla okumamalıyız. CoV-2 testi” dedi Dr. Çiçek açmak.
Ancak dışarıdan uzmanlar, numunelerin çeşitli özelliklerinin hayvan ve viral materyal arasında bağlantı kurma çabalarını engelleyebileceğini söyledi. Uluslararası bilim adamları raporlarında benzer bir analiz yapmayı düşündüklerini ancak yanıltıcı sonuçlar verme riskinin olduğunu söylediler. doktor Bloom, “hesaplamanın anlamlı olup olmadığı açık bir soru” olduğunu kabul etti.
Weill Cornell Medicine’de çevresel numune alma uzmanı olan Christopher Mason, virüsün genetik materyalinin hızla bozulduğunu söyledi. En önemlisi, viral materyal hayvanlardan alınan materyalden farklı bir oranda parçalanabilir ve bu da pazar kapandıktan sonraki haftalar boyunca toplanan örneklerde bunların karşılaştırılmasını zorlaştırabilir.
Belçika’daki KU Leuven’de evrimsel bir biyolog olan Tom Wenseleers, balığın virüsle en yakından ilişkili olmasının nedeni, balığın muhtemelen donmuş veya buzdolabında olması olabilir, bu da bu örneklerdeki viral materyalin çürümesini yavaşlattı.
Dr. Wenseleers. Bu, bilim adamlarını daha önce olduğu gibi aynı pozisyonda bırakıyor, dedi, piyasa verileri herhangi bir belirli köken senaryosu için kesin bir kanıt sunmuyor.
Yeni çalışma ayrıca, uluslararası ekibin rakun köpeklerinin genetik imzalarının yanı sıra virüsün izlerini bulduğu, ancak saptanabilir insan genetik materyali bulunmadığı, pazardaki bir arabadan alınan bir sürüntüyü de yakından inceledi.
doktor Bloom, sürüntünün yalnızca çok az miktarda viral malzeme içerdiğini ve Çinli araştırmacıların çubuğu neden Kovid pozitif olarak sınıflandırdığının net olmadığını yazdı. Çalışması, sürüntünün virüs izleri içeren önemli miktarda rakun köpeği genetik materyali içeren tek örnek olduğunu söyledi.
Ancak bazı bilim adamları, Dr. Bloom’un analizi, bir numunedeki hayvan genetik materyali miktarı için çıtayı çok yükseğe ayarlayarak diğer Covid-pozitif sürüntülerin reddedilme riskini aldı.
doktor Pennsylvania Üniversitesi’nden Bushman, analizde kullanılan eşiğin “agresif” olduğunu ve bir dizi farklı eşikten elde edilen sonuçları karşılaştırmanın en iyisi olduğunu söyledi.
Uluslararası bilim insanları ekibi, daha hassas bir eşik kullanarak, rakun köpeklerinden genetik materyal içeren birkaç Kovid-pozitif numunenin yanı sıra virüse duyarlı olduğu düşünülen farklı hayvanlardan genetik imzalara sahip diğerleri belirledi.
Daha önce Johns Hopkins Üniversitesi’nde çalışan ve uluslararası ekibin analizine öncülük eden hesaplamalı bir biyolog olan Alexander Crits-Christoph, ekibin ayrıca Çinli araştırmacıların arabadan alınan sürüntü testinde virüsü tanımladığı için pozitif olup olmadığını dikkatlice kontrol ettiğini söyledi.
Aynı ahırdan alınan bir dizi başka sürüntünün virüs için açıkça pozitif olduğunu buldu. Pazarda başka bir yerden alınan örneklerden elde edilen sonuçların, gerçekten negatif olan eküvyonların çoğunun, arabadan alınan eküvyonların aksine hiçbir virüs izi içermediğini gösterdiğini söyledi.
“Bu, samanlıkta küçük bir iğne olan bir virüsün çevresel örneklemesidir” dedi Dr. Crits-Christoph.