11 Ocak 2020’de, Şangay’da, Fudan Üniversitesi’nden Yong-Zhen Zhang liderliğindeki bir bilim insanı ekibi, Wuhan’daki salgının dünya çapında ilk kez yayılmasından sadece 11 gün sonra, Virological.org adlı bir web sitesi aracılığıyla yeni virüsün taslak genom dizisini yayınladı. Genom, Sidney’de yaşayan Anglo-Avustralyalı bir evrimsel biyolog ve genom birleştirme projesinde Zhang’ın bir meslektaşı olan Edward C. Holmes tarafından sağlandı. Holmes, virologlar arasında RNA virüslerinin (koronavirüsler dahil) evrimi konusundaki çalışmaları, kusursuz kelliği ve keskin açık sözlülüğüyle ünlüdür. Sektördeki herkes onu Eddie olarak tanıyor. Yayın, İskoç saatiyle 01:05’te yapıldı. Bu noktada sitenin Edinburgh’daki küratörü, moleküler evrim profesörü Andrew Rambaut tetikteydi ve işleri ileriye götürmeye hazırdı. O ve Holmes genoma kısa bir giriş yazdılar: “Lütfen bu verileri indirmekten, paylaşmaktan, kullanmaktan ve analiz etmekten çekinmeyin” dedi. “Veri”nin çoğul olduğunu biliyorlardı ama aceleleri vardı.
Holmes ve küçük bir meslektaş grubu, virüsün evrimsel geçmişine dair ipuçları bulmak için hemen genomu analiz etmeye koyuldu. Bilinen koronavirüslerin arka planından ve bu tür virüslerin vahşi doğada nasıl şekillendiğine dair kendi anlayışlarından yararlandılar (Holmes’ın 2009 tarihli The Evolution and Emergence of RNA Viruses kitabında yansıtıldığı gibi). Koronavirüs evriminin, sık mutasyonlar (yaklaşık 30.000 harflik bir genomdaki bireysel harflerin değişmesi), rekombinasyon (bir virüs, her ikisi de tek bir hücrede aynı anda çoğaldığında genom segmentlerini başka bir virüsle değiştirir) ve bu rastgele değişikliklere göre hareket eden Darwinci doğal seçilim tarafından yönlendirilerek hızla gerçekleşebileceğini biliyorlardı. Holmes, Edinburgh’da otuz yıllık bir arkadaşı olan Rambaut ve diğer iki meslektaşıyla fikir alışverişinde bulundu: La Jolla, California’daki Scripps Research’ten Kristian Andersen; ve New Orleans’taki Tulane Üniversitesi Tıp Fakültesi’nden Robert Garry. Columbia Üniversitesi’nin Mailman Halk Sağlığı Okulu’ndan Ian Lipkin daha sonra gruba katıldı. Bu beş kişi, amacı SARS-CoV-2’nin genomu ve olası kökeni hakkında bir makale yayınlamak olan bir tür uzaktan çalışma grubu oluşturacaktır.
Holmes, Andersen ve meslektaşları, virüsün yarasa virüslerine benzerliğini fark ettiler, ancak daha fazla araştırma yaptıktan sonra onları düşündüren iki “olağanüstü özellik” keşfettiler. Genomun iki kısa uzantısı olan bu özellikler, bütünün çok küçük bir yüzdesini oluşturuyordu, ancak virüsün insan hücrelerini tutma ve enfekte etme yeteneğinde büyük önem taşıyor olabilir. Virologların aşina olduğu ve artık orijinal Covid dilinin bir parçası olan kulağa teknik gelen unsurlar içeriyordu: bir furin bölünme bölgesi (FCS) ve beklenmedik bir reseptör bağlama alanı (RBD). Tüm virüslerin hücrelere bağlanmalarına yardımcı olan RBD’leri vardır; FCS, belirli virüslerin girişini kolaylaştıran bir özelliktir. Dünya çapında bilim insanlarını dehşete düşüren ancak yalnızca yaklaşık 800 kişinin ölümüne neden olan orijinal SARS virüsü, yeni koronavirüse hiç benzemiyordu. SARS-CoV-2 bu formu nasıl alabilir?
Andersen ve Holmes başlangıçta bunun yapay bir yapı olabileceğine dair ciddi endişelere sahipti. Bu iki özellik, genetik manipülasyon yoluyla koronavirüsün omurgasına kasıtlı olarak eklenerek virüsü insanlar için kasıtlı olarak daha bulaşıcı ve patojen hale getirdi mi? Düşünülmesi gerekiyordu. Holmes, o zamanlar Londra’da sağlık araştırmalarını destekleyen bir vakıf olan Wellcome Trust’ın direktörü olan bir hastalık uzmanı olan Jeremy Farrar’ı aradı. Farrar noktayı gördü ve genomun şaşırtıcı yönlerini ve oluşumu için olası senaryoları tartışmak üzere uluslararası bir grup bilim insanı ile hızlı bir şekilde bir konferans görüşmesi ayarladı. Grupta Tulane’den Robert Garry ve Edinburgh’dan Rambaut, Hollanda’dan Marion Koopmans ve Almanya’dan Christian Drosten gibi çoğu ilgili uzmanlığa sahip saygın Avrupalı veya İngiliz bilim adamlarından oluşan bir düzine kişi vardı. Sohbete, o zamanlar Ulusal Alerji ve Bulaşıcı Hastalıklar Enstitüsü müdürü olan Anthony Fauci ve o zamanlar Ulusal Sağlık Enstitüleri müdürü ve dolayısıyla Fauci’nin patronu olan Francis Collins de katıldı. Bu, bazı eleştirel seslere inanılacak olursa, Fauci ve Collins’in diğerlerini virüsün tahrif edilmiş olabileceğine dair her türlü fikri ortadan kaldırmaya ikna ettikleri ünlü 1 Şubat çağrısı.
“Ortada dolaşan anlatı, Fauci’nin bize, yada, yada, yada, yada fikrimizi değiştirdiğini söylüyordu. Ödeme aldık,” dedi Holmes. “O bitti [expletive]”
Holmes ve küçük bir meslektaş grubu, virüsün evrimsel geçmişine dair ipuçları bulmak için hemen genomu analiz etmeye koyuldu. Bilinen koronavirüslerin arka planından ve bu tür virüslerin vahşi doğada nasıl şekillendiğine dair kendi anlayışlarından yararlandılar (Holmes’ın 2009 tarihli The Evolution and Emergence of RNA Viruses kitabında yansıtıldığı gibi). Koronavirüs evriminin, sık mutasyonlar (yaklaşık 30.000 harflik bir genomdaki bireysel harflerin değişmesi), rekombinasyon (bir virüs, her ikisi de tek bir hücrede aynı anda çoğaldığında genom segmentlerini başka bir virüsle değiştirir) ve bu rastgele değişikliklere göre hareket eden Darwinci doğal seçilim tarafından yönlendirilerek hızla gerçekleşebileceğini biliyorlardı. Holmes, Edinburgh’da otuz yıllık bir arkadaşı olan Rambaut ve diğer iki meslektaşıyla fikir alışverişinde bulundu: La Jolla, California’daki Scripps Research’ten Kristian Andersen; ve New Orleans’taki Tulane Üniversitesi Tıp Fakültesi’nden Robert Garry. Columbia Üniversitesi’nin Mailman Halk Sağlığı Okulu’ndan Ian Lipkin daha sonra gruba katıldı. Bu beş kişi, amacı SARS-CoV-2’nin genomu ve olası kökeni hakkında bir makale yayınlamak olan bir tür uzaktan çalışma grubu oluşturacaktır.
Holmes, Andersen ve meslektaşları, virüsün yarasa virüslerine benzerliğini fark ettiler, ancak daha fazla araştırma yaptıktan sonra onları düşündüren iki “olağanüstü özellik” keşfettiler. Genomun iki kısa uzantısı olan bu özellikler, bütünün çok küçük bir yüzdesini oluşturuyordu, ancak virüsün insan hücrelerini tutma ve enfekte etme yeteneğinde büyük önem taşıyor olabilir. Virologların aşina olduğu ve artık orijinal Covid dilinin bir parçası olan kulağa teknik gelen unsurlar içeriyordu: bir furin bölünme bölgesi (FCS) ve beklenmedik bir reseptör bağlama alanı (RBD). Tüm virüslerin hücrelere bağlanmalarına yardımcı olan RBD’leri vardır; FCS, belirli virüslerin girişini kolaylaştıran bir özelliktir. Dünya çapında bilim insanlarını dehşete düşüren ancak yalnızca yaklaşık 800 kişinin ölümüne neden olan orijinal SARS virüsü, yeni koronavirüse hiç benzemiyordu. SARS-CoV-2 bu formu nasıl alabilir?
Andersen ve Holmes başlangıçta bunun yapay bir yapı olabileceğine dair ciddi endişelere sahipti. Bu iki özellik, genetik manipülasyon yoluyla koronavirüsün omurgasına kasıtlı olarak eklenerek virüsü insanlar için kasıtlı olarak daha bulaşıcı ve patojen hale getirdi mi? Düşünülmesi gerekiyordu. Holmes, o zamanlar Londra’da sağlık araştırmalarını destekleyen bir vakıf olan Wellcome Trust’ın direktörü olan bir hastalık uzmanı olan Jeremy Farrar’ı aradı. Farrar noktayı gördü ve genomun şaşırtıcı yönlerini ve oluşumu için olası senaryoları tartışmak üzere uluslararası bir grup bilim insanı ile hızlı bir şekilde bir konferans görüşmesi ayarladı. Grupta Tulane’den Robert Garry ve Edinburgh’dan Rambaut, Hollanda’dan Marion Koopmans ve Almanya’dan Christian Drosten gibi çoğu ilgili uzmanlığa sahip saygın Avrupalı veya İngiliz bilim adamlarından oluşan bir düzine kişi vardı. Sohbete, o zamanlar Ulusal Alerji ve Bulaşıcı Hastalıklar Enstitüsü müdürü olan Anthony Fauci ve o zamanlar Ulusal Sağlık Enstitüleri müdürü ve dolayısıyla Fauci’nin patronu olan Francis Collins de katıldı. Bu, bazı eleştirel seslere inanılacak olursa, Fauci ve Collins’in diğerlerini virüsün tahrif edilmiş olabileceğine dair her türlü fikri ortadan kaldırmaya ikna ettikleri ünlü 1 Şubat çağrısı.
“Ortada dolaşan anlatı, Fauci’nin bize, yada, yada, yada, yada fikrimizi değiştirdiğini söylüyordu. Ödeme aldık,” dedi Holmes. “O bitti [expletive]”